Marchés publics

La prestation vise à étudier les effets combinés d’un stress biotique - le parasite Anguillicola crassus - et d’un stress abiotique - le polluant émergent Bisphénol S ou BPS - sur la physiologie de l’anguille européenne - Anguilla anguilla - une espèce sentinelle en danger critique d’extinction.

Prestation de séquençage par l’approche Enzyme Methyl sequencing (EM-seq) ayant pour objectif de caractériser le méthylome de 4 populations de gambusies (Gambusia affinis)

Dans le cadre du projet ANR DYSCORD, nous souhaitons séquencer l’ADN génomique de plusieurs centaines de lignées d’Arabidopsis thaliana afin d’identifier la position génomique de transgène comportant le système de visualisation génomique ANCHOR. Techniquement, nous souhaitons que ce séquençage soit réalisé avec des lectures courtes type Illumina en pair-end.

Prestations de séquençage haut débit pour le projet GAZFROM Impact de l’environnement oxydo-réducteur sur l’écosystème microbien des fromages : une approche transcriptomique pour décrypter les interactions et les voies métaboliques

Prestations de séquençage shotgun métagénomique des communautés microbiennes de la rhizosphère pour le laboratoire d’Ecologie Microbienne (UMR5557 du CNRS)

Prestations de séquençage haut débit pour le projet TRANSCRIPTOBIO : Effet de molécules biostimulantes et de biocontrôle sur le transcriptome racinaire

Prestations de séquençage haut débit pour le projet HOLOSTRESS : Etude de la réponse du transcriptome des racines de plants de pois et de vignes à des microorganismes et des molécules impliquées dans le biocontrôle et la biostimulation

Prestation de séquençage haut débit RNASeq pour expérimentation ayant pour objectif de caractériser le transcriptome de six familles d’huîtres au cours de leur élevage.

Prestations de séquençage haut débit dans le projet METABARCODING : étude de la diversité des microorganismes associés aux racines de différentes plantes mais aussi présents dans les sols

L’équipe "Biologie théorique" au sein du Laboratoire Génome et Développement des Plantes (LGDP) souhaite séquencer les ARNm de cultures d’Ostreococcus en utilisant la technologie de type Illumina (RNAseq).

L’objet de la présente consultation consiste en la préparation de librairies et le séquençage avec la technologie illumina d’ARNm et de petits ARN de plusieurs échantillons de Drosophile. Les ARN sont extraits à partir d’adultes entiers ou d’ovaires, dans le cadre du projet ANR LongevitY.

L’équipe « Nucléole » au sein du laboratoire génome et développement des plantes (LGDP) souhaite séquencer les ARNm de plantes d’Arabidopsis en utilisant la technologie de type lectures courtes Illumina (RNAseq).

Prestations séquençages ADN ARN (projet ClimaLoca)

Prestations séquençages ADN ARN (projet ClimaLoca)

LOT 1 Séquençage à très haut débit des échantillons d’ADN

LOT 2 Services de pré-traitement bioinformatique « préprocessing » des données brutes de séquençage de la méthylation d’ADN

LOT 3 Séquençage à très haut débit des échantillons des ARN

LOT 4 Services de pré-traitement bioinformatique « préprocessing » des données brutes de transcriptome ARN

Achat de séquençages d’acides nucléiques - Séquençage Sanger

Achat de séquençages d’acides nucléiques - Séquençage de génomes complets de microorganismes (NGS)

Achat de séquençages d’acides nucléiques - Séquençage métagénomique de populations microbiennes (NGS)

Achat de séquençages d’acides nucléiques - Séquençage métatranscriptomique (RNASeq) de populations microbiennes complexes et de cultures microbiennes pures

Le présent accord-cadre est un accord-cadre mono-attributaire, dont l’objet est de définir les termes régissant les bons de commande à émettre pour la réalisation de prestations de séquençage sur cellule unique (scRNA-seq) et d’analyses bio-informatiques.

L’équipe « ReDAC » au LGDP (Laboratoire Génome et Développement des Plantes UMR5096 à Perpignan) a besoin de générer le profil d’expression de plantes d’Arabidopsis thaliana, Medicago truncatula et Triticum durum soumis à des conditions de stress de type

Le présent marché a pour objet la fourniture de séquençage d’ARN (RNA-seq), à partir d’ARN totaux et/ou d’échantillons biologiques selon le type de prestation RNA-seq.